LION bioscience AG bringt neue Software für Genomforschung auf den Markt: SRS everEST™
"Die Mehrheit der auf dem Markt verfügbaren EST Clustering Programme geht nicht über eine reine Zusammenstellung der einzelnen ESTs hinaus. Es ist aber äußerst wichtig biologische Informationen über EST Konsensus-Sequenzen und rekonstruierte Gene zu erhalten." sagt Dr. Paul Selzer, Leiter der Bioinformatik der Intervet Innovation GmbH. "Mit SRS everEST™ können wir dieses Ziel schneller erreichen, weil wir durch die einzigartige Leistungsfähigkeit von SRS, Genen bestimmte Funktionen zuweisen können. Außerdem verfügen wir damit über eine extrem robuste Clustering-Software. Mit SRS everEST™ steht uns nun eine Fülle von Informationen aus eigenen sowie öffentlichen Datenbanken direkt zur Verfügung."
SRS everEST™ ermöglicht ein effizientes Clustering von Expressed Sequence Tags (ESTs) sowie die Zuweisung von biologischer Information zu diesen Clustern. Momentan werden weltweit für mehr als 250 verschiedene Organismen EST-Projekte durchgeführt. Diese Zahl wird zukünftig weiter ansteigen. Aufgrund seiner direkten Verbindung zu LION´s Datenintegrationssystem SRS, bietet SRS everEST™ die einmalige Möglichkeit, Gensequenzen biologische Information zuzuordnen. Gleichzeitig wird die intuitive und unkomplizierte Datenanalyse durch die graphische Darstellung ermöglicht.
SRS everEST™ verwendet die neueste Version des EST Clustering-Programms stack-PACK™, das von Electric Genetics in Capetown, Südafrika, entwickelt wurde. StackPACK™ ist das einzige wissenschaftlich publizierte Clustering-System, das bisher verfügbar ist. Es ermöglicht die schnelle Zusammensetzung von vollständigen Gensequenzen aus Einzelfragmenten. Aufgrund der speziellen Technologie von stackPACK™ können Expressions- und Transkriptvarianten identifiziert werden, die bei anderen EST Clustering Programmen unentdeckt bleiben.
"SRS everEST™ ist die erste auf dem Markt erhältliche Software, die eine schnelle Zusam-menstellung von ESTs ermöglicht und eine Verbindung zwischen den resultierenden Clustern mit der Fülle öffentlich zugänglicher biologischer Daten ermöglicht," sagt Dr. Jan Mous, Vorstand Forschung bei der LION bioscience AG. "SRS everEST™ ist ein wichtiges neues Modul unserer Produktpalette für die moderne Genom-Forschung. Es erlaubt Forschern mit der rasanten Entwicklung auf dem Feld der Transkriptom- und Genomik-Forschung Schritt zu halten."
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